Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsbP10605 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtsbP10605 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtsbP10605 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms