Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Schip1P0DPB4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Schip1P0DPB4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms