Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csf3P09920 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms