Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CfhP06909 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CfhP06909 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CfhP06909 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CfhP06909 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CfhP06909 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CfhP06909 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CfhP06909 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CfhP06909 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CfhP06909 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CfhP06909 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CfhP06909 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CfhP06909 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CfhP06909 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CfhP06909 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CfhP06909 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CfhP06909 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CfhP06909 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CfhP06909 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CfhP06909 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CfhP06909 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CfhP06909 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CfhP06909 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CfhP06909 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CfhP06909 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CfhP06909 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CfhP06909 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CfhP06909 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfhP06909 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfhP06909 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CfhP06909 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfhP06909 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfhP06909 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfhP06909 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfhP06909 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CfhP06909 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CfhP06909 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CfhP06909 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CfhP06909 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms