Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P06321 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06321 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P06321 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P06321 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P06321 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P06321 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P06321 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
P06321 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P06321 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06321 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06321 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P06321 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06321 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06321 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06321 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06321 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06321 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06321 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P06321 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06321 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P06321 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P06321 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P06321 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P06321 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P06321 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P06321 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms