Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04942 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04942 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04942 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04942 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04942 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04942 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04942 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04942 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms