Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GzmbP04187 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GzmbP04187 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms