Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa7P02830 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa7P02830 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms