Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01915 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01915 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01915 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01915 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01915 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01915 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01915 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01915 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01915 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms