Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01783 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01783 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01783 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01783 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01783 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01783 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01783 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01783 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01783 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms