Protein–RNA interactions for Protein: P01630

Ig kappa chain V-II region 7S34.1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01630 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01630 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01630 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01630 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01630 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01630 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01630 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01630 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01630 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01630 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01630 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01630 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01630 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01630 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01630 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms