Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl20O89093 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl20O89093 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms