Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3pxd2aO89032 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3pxd2aO89032 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms