Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MscO88940 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MscO88940 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MscO88940 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MscO88940 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MscO88940 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MscO88940 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MscO88940 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MscO88940 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MscO88940 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MscO88940 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MscO88940 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MscO88940 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MscO88940 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MscO88940 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MscO88940 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MscO88940 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MscO88940 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MscO88940 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MscO88940 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MscO88940 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms