Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3fO88632 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3fO88632 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms