Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cfdp1O88271 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfdp1O88271 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms