Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxq1O70220 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxq1O70220 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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