Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atf5O70191 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atf5O70191 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atf5O70191 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf5O70191 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf5O70191 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atf5O70191 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms