Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb5O55234 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb5O55234 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms