Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2a2O55143 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2a2O55143 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp2a2O55143 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms