Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif6O55135 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eif6O55135 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Eif6O55135 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Eif6O55135 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif6O55135 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif6O55135 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms