Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg2O55111 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms