Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SlkO54988 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SlkO54988 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SlkO54988 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SlkO54988 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SlkO54988 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SlkO54988 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SlkO54988 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SlkO54988 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SlkO54988 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SlkO54988 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SlkO54988 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SlkO54988 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SlkO54988 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SlkO54988 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms