Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole2O54956 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole2O54956 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms