Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a2O54833 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a2O54833 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms