Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp10aO54827 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp10aO54827 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms