Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek2O35942 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek2O35942 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek2O35942 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek2O35942 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek2O35942 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms