Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn1mwO35599 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn1mwO35599 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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