Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih1O35372 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih1O35372 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms