Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KeraO35367 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KeraO35367 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KeraO35367 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KeraO35367 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KeraO35367 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KeraO35367 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KeraO35367 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KeraO35367 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KeraO35367 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KeraO35367 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KeraO35367 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KeraO35367 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KeraO35367 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KeraO35367 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KeraO35367 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KeraO35367 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KeraO35367 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KeraO35367 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KeraO35367 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KeraO35367 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KeraO35367 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KeraO35367 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms