Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad6O35182 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad6O35182 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad6O35182 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smad6O35182 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smad6O35182 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms