Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq1O09165 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq1O09165 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq1O09165 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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