Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ncoa3O09000 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Ncoa3O09000 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ncoa3O09000 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms