Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcshO08795 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcshO08795 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms