Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CckarO08786 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CckarO08786 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CckarO08786 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CckarO08786 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CckarO08786 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CckarO08786 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckarO08786 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckarO08786 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckarO08786 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckarO08786 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckarO08786 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckarO08786 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckarO08786 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CckarO08786 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckarO08786 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckarO08786 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckarO08786 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckarO08786 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CckarO08786 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms