Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp12O08736 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Casp12O08736 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp12O08736 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp12O08736 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp12O08736 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casp12O08736 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casp12O08736 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms