Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sec22bO08547 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sec22bO08547 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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