Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm20939L7N243 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm20939L7N243 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm20939L7N243 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm20939L7N243 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm20939L7N243 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm20939L7N243 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm20939L7N243 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm20939L7N243 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20939L7N243 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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