Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa3bJ9JI28 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3bJ9JI28 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3bJ9JI28 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms