Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21900J3QP38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms