Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm6594J3QM43 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6594J3QM43 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6594J3QM43 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm6594J3QM43 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm6594J3QM43 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm6594J3QM43 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm6594J3QM43 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6594J3QM43 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms