Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20830J3KML6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20830J3KML6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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