Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r67G5E8C1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms