Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r34G3XA52 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms