Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Pcf11G3X9Z4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pcf11G3X9Z4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms