Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r58G3X9U3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms