Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf148G3X9R7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf148G3X9R7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms