Protein–RNA interactions for Protein: G3X9J0

Sipa1l3, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1l3G3X9J0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sipa1l3G3X9J0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sipa1l3G3X9J0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sipa1l3G3X9J0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sipa1l3G3X9J0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sipa1l3G3X9J0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sipa1l3G3X9J0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sipa1l3G3X9J0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms