Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp846G3X996 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp846G3X996 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp846G3X996 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp846G3X996 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp846G3X996 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp846G3X996 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp846G3X996 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp846G3X996 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp846G3X996 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms