Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nkx1-1G3UXB3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-1G3UXB3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-1G3UXB3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms